2.排毒作用。肝脏通过一系列酶促反应，将来自饲料（霉菌毒素，药物残留）、水体（氨氮、亚硝酸盐、重金属）、体内代谢的有毒物质（如氨）进行转化。若肝脏受损，会直接影响鱼的代谢功能，像鱼的“尾巴末端发白”“眼睛凹陷”等，都是因为肝脏受损，导致鱼体内毒素无法正常排出导致。
3.免疫作用。鱼的肝脏富含免疫细胞，可以吞噬和清除体内的细菌、病毒、寄生虫，内毒素以及异物颗粒等。而且鱼的肝脏可以合成多种免疫蛋白质，在鱼体受到感染和损伤时，发挥重要的防御和调节作用。若肝脏受损，免疫力随之下降，“鱼应激溜边”、“鱼病久治不愈”、“鱼长期零星死亡”等，这都是因为肝脏不好，导致免疫力下降导致。
4.凝血作用。鱼的肝脏是合成血浆凝血因子的重要场所，同时还合成一些抗凝血酶，在凝血和抗凝之间维持动态平衡，防止血栓形成或者出血不止。若肝脏受损，血的凝血功能下降或凝血和抗凝平衡被打破，会导致“鱼鳃部渗血”、“鱼不耐运输（鱼体出血）”、“加州鲈血窦（血栓）”等，直接影响品质和运输成活率。
三、肠道
1.消化作用。鱼的肠道是营养物质消化和吸收的主要场所，承担着从外界摄取物质和能量的关键角色。
2.免疫防御。肠道黏膜是鱼类重要的免疫屏障，黏膜上的黏液能黏附病原体，黏膜中的免疫细胞（如淋巴细胞、巨噬细胞）和抗体可直接杀灭入侵的细菌、病毒，阻止有害物质进入体内。
3.鱼体肠道在调节鱼体代谢和生理功能方面也发挥着不可或缺的作用。肠道中的微生物群参与营养功能，免疫调节以及抑制病原菌等多个方面。
4.作为鱼体的生物屏障。鱼体肠道能够有效抵御细菌的入侵，并且阻止有毒有害物质的吸收。
四、肾脏
在发生上为前肾和中肾。前肾是鱼类胚胎时期的主要泌尿器官，负责排泄代谢废物和调节体内渗透压。成鱼的前肾通常退化，功能减弱或消失；中肾是鱼类成体的主要泌尿器官。
1.排泄功能。肾脏是主要的排泄器官，负责排泄水、无机盐、尿酸等代谢废物。
2.调节水盐平衡。淡水鱼的肾脏通过排出大量稀释尿液，防止体内水分过多积累，并重新吸收尿液中的有用盐分，以维持体内的盐分平衡。海水鱼通过肾脏排出高浓度的盐分，同时保留水分，以应对周围高盐环境导致的水分流失。
3.酸碱平衡调节。肾脏通过调节酸性和碱性物质的排泄和重吸收，帮助鱼类适应不同的水环境。
4.免疫和造血功能。鱼类的头肾含有淋巴组织、肾间组织、嗜络组织，具有免疫调节和产生应激的功能。头肾主要作为淋巴器官，能够产生白细胞并清除衰老的红细胞。此外，鱼体的肾脏还是造血器官之一，与脾脏、肝脏以及肠道一些结缔组织共同参与造血。
五、脾脏
脾脏是主要的造血器官，也是重要的外周免疫器官。脾脏是红细胞和粒细胞产生、成熟和储存的主要器官。大多数鱼类的脾脏主要由椭圆体，脾髓以及黑素巨噬细胞中心组成。
1.免疫功能。脾脏是鱼类的主要外周免疫器官，脾脏有大量淋巴细胞，参与体液免疫和炎症反应。脾脏中的黑素巨噬细胞中心可以吞噬和破坏血液中的异物，起到储存、破坏或脱毒的作用，并在抗原提呈和启动获得免疫中发挥重要作用。
2.造血功能。脾脏是红细胞和粒细胞产生、储存和成熟的主要器官，能够制造白血球，并清除失去功能的红血球。与肾脏、肝脏等器官共同维持造血功能的正常运作。
3.保护作用。脾脏在保护组织免受自由基损伤方面也具有一定作用。
六、心脏
1.推动血液循环。鱼类心脏是循环系统的核心动力器官。心脏通过有节律的收缩和舒张，将血液泵送到鱼体全身。
2.实现物质运输。血液循环在心脏的推动下，将氧气和营养物质输送到鱼体的各个组织和器官，同时将代谢废物（如二氧化碳等）运输到排泄器官排出体外，维持鱼体内环境的稳定。
3.参与免疫防御。循环系统中的白细胞和抗体等免疫细胞能够抵御病原体的入侵，保护鱼类健康。
4.调节生理功能。鱼类心脏还参与调节血压和血容量，维持身体内稳定的内环境，此外，心中的活动还受到神经和激素的调节，以适应不同的生理需求和环境变化。
七、鱼鳔
1.调节浮力。鱼鳔通过调节气体含量来改变鱼体的比重，帮助鱼在水中实现上浮或下沉。使得鱼能够在不同水层中保持稳定，无需消耗过多能量。
2.辅助呼吸。在某些鱼类中，鳔具有辅助呼吸的功能。例如，肺鱼的鳔可以在特定条件下充当肺，从空气中获取氧气。
3.发声功能。部分鱼类可以利用鳔来发声。它们通过收缩肌肉使鳔震动，从而产生声音。这些声音在鱼类的求偶、领地争夺等行为中起到了重要的作用。
4.感觉功能。鳔中含有一些感觉细胞，能够感知水压的变化和声波的震动。有助于鱼类在水中更好地感知周围环境，及时发现潜在危险和猎物。
八、鳞片
鱼鳞由蛋白质和钙质组成。鳞片的形状和大小各异，也有一些特殊的没有鳞片的鱼，比如海鳗、海鳝、安康鱼等没有鳞片，鲳鱼、带鱼、马鲛鱼、金枪鱼等海鱼鳞片细小不易发现，也常算作无鳞鱼；在淡水中，鳗鲡、黄鳝、鲶鱼、黄颡鱼等属于无鳞鱼。
1.保护作用。因为鳞片由钙质组成，所以坚硬得可以抵挡外界的一些攻击。鳞片为鱼体提供保护屏障，有效地隔绝了周围的微生物，从而帮助鱼类避免感染和抵抗疾病。无鳞鱼的皮肤会分泌出粘液或拥有紧密而厚的皮肤，替代鳞片的功能，从而保护鱼体免受外界伤害。
2.伪装作用。鱼的肚皮部分，鳞片可以反射和折射亮光，犹如一面镜子，使得鱼儿的身体和周围环境融为一体，难以被发现。
3.减阻作用。鳞片的排列方式和形状都有利于减少摩擦，提高速度，降低在水中的阻力，使得鱼可以快速游动。
九、粘液
1.保护作用。粘液可以形成一层保护膜，阻止水中的杂质、寄生虫或细菌等侵入鱼的皮肤，防止有害物质进入体内；粘液中含有多种活性物质，如溶菌酶、免疫球蛋白等，这些物质可以直接杀死或中和水中的病原体，或者激活鱼自身的免疫系统，增强鱼对病原体的抵抗力；粘液可以减少鱼类在水中运动时候的摩擦力，对鱼类皮肤起到润滑作用，降低鱼皮肤的磨损。
2.适应环境。粘液可以使鱼皮肤不透水，有助于维持鱼体内渗透压的恒定，帮助一些江河洄游的鱼类适应水中盐度的变化；鱼类鳃上皮粘液细胞在亚致死剂量下，能够分泌大量粘液，在鳃表面形成一层保护膜；对酸胁迫也有一定抵抗作用；如果鱼离开水以后，粘液可以结合水，防止鱼类短期离开水环境时皮肤干燥，延长存活时间。
3.帮助繁殖。在生殖季节，有些雄鱼用粘液粘住一些植物形成鱼巢，便于雌鱼产卵。
4.清洁环境。粘液可以凝结和沉淀水中浮泥的力量，对栖息在浑浊水中的鱼类，有一定清洁作用；对栖息在清水中的鱼类，当洪水或暴雨后引起水浑浊时，粘液使得身体表面和鳃中的泥沉淀，保证鱼体表面光滑，鳃清洁，顺利地进行呼吸，维持生命。
5.特殊功能。电鳗的粘液中含有能导电的物质，增强电鳗发出的电信号，用于捕食或防御。石首鱼的粘液含有能够释放毒素的物质，用于防御或捕食。
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